多忙につき、お返事遅くなりすいません。もう見ていないかもですが、一応回答しておきます。All-in-One WP Migrationと500　Internal Server Errorは関係ないかもしれません。500　Internal Server Errorの症状を改善したのち、All-in-One WP Migrationを使う流れでしょうか。500　Internal Server Errorの原因は様々な理由があるため、こちらではなかなかわかりません。。ぐぐって調査する流れになりますでしょうか。ただ、直近にいじったところがまずい場合が少なくありません。